一、预缴税款增值税税率
根据《国家税务总局关于发布〈纳税人跨县（市、区）提供建筑服务增值税征收管理暂行办法〉的公告》（国家税务总局公告2016年第17号）及《财政部 税务总局关于建筑服务等营改增试点政策的通知》（财税〔2017〕58号）规定，一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，适用一般计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照2%的预征率在建筑服务发生地预缴税款。
对于清包工项目，如果没有申请简易征收，即选择适用一般计税方法，异地预缴增值税时应按照2%的预征率计算预缴税款，而非3%。
二、开票税率
一般纳税人提供建筑服务，适用一般计税方法的，增值税税率为9%。因此，对于未申请简易征收的清包工项目，开具发票时税率应为9%。
三、注意要点
- 预缴税款计算：应预缴税款＝（全部价款和价外费用－支付的分包款）÷（1＋9%）×2%。
- 清包工项目虽符合简易计税条件，但企业未选择简易计税的，仍按一般计税方法处理，预征率为2%，开票税率为9%。
- 预缴税款需在建筑服务发生地主管税务机关办理，并取得完税凭证。
- 纳税申报时，已预缴的税款可在当期应纳税额中抵减。
综上，一般纳税人建筑安装企业异地施工清包工项目未申请简易征收的，预缴增值税按2%预征率计算，开票税率为9%。
